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CBV30021hCov-OC43-N 假病毒標準品的詳細資料:
HCoV-229E和HCoV-OC43都是在1960年代發現的,多年來一直被*為引起普通感冒的原因,并在一生中引起頻繁的再感染。在成年人中,這些病毒每年占急性呼吸道疾病的 4%至15%,在高峰期高達35%。兒童的年發病率達到8%,發病率高達20%。據報道,成人中229E和OC43病毒的感染頻率為每年每100人15至25人不等,其中有80%的感染者是先前具有該感染病毒抗體的人。
NCBI收錄序列為KX344031.1,全長30713bp,基因編碼5個結構蛋白:S,M,N,HE和E。
- S蛋白(spike protein)穿過病毒膜,并在冠狀病毒“冠狀”中形成特征性的尖峰。它被高度糖基化,可能形成同源三聚體,并介導受體結合和與宿主細胞膜融合。刺激中和抗體的主要抗原以及細胞毒性淋巴細胞的重要靶標在S蛋白上。
- M蛋白(membrane glycoprotein)具有一個短的N末端結構域,該結構域在包膜的外表面上突出并跨過該包膜3次,在包膜內留有一個長的C末端。M蛋白在病毒裝配中起重要作用。
- 核衣殼蛋白N(nucleocapsid phosphoprotein)與RNA基因組結合形成核衣殼。它可能參與病毒RNA合成的調控,并可能在病毒出芽過程中與M蛋白相互作用。
- HCoV-OC43中發現血凝素酯酶糖蛋白(HE)。血凝素部分與宿主細胞表面的神經氨酸結合,可能使病毒初吸附到膜上。酯酶從神經氨酸裂解乙?;?。冠狀病毒的HE基因與C型流感HE糖蛋白具有序列同源性,可能反映了這兩種病毒之間的早期重組。
- 小包膜E(envelope protein)蛋白將其C末端留在包膜內,然后跨越該包膜或彎曲并在內部投射其N末端。
根據CDC和WHO的介紹,針對HCoV-OC43的核酸診斷一般是針對RdRP (RNA-dependent RNA polymerase)、Gene N和Gene E, Gene S更多用于對應藥物和疫苗的開發。
以往針對試劑盒檢測限的性能評價,一般是選擇體外轉錄的RNA、或者臨床陽性病毒來作為標準品,用于性能評價。但是兩者都具有很明顯的確定,首先體外轉錄的RNA,一般是很純,單一,不涉及提取,不符合臨床病毒的微環境,因此必然造成檢測靈敏度被高估,這也是存在高概率假陰性的主要原因;再次臨床陽性病毒,即使是滅活的病毒,也是存在很大的生物安全隱患,因此要求實驗室級別為P3-P4,大部分開發診斷試劑盒單位都不滿足改要求,另外臨床陽性病毒也是來源很有限,不能被穩定供應,反復用于試劑盒的性能評價。
因此,有病毒的完整包膜結構,有HCoV-OC43對應的核酸序列,但是生物安全風險較低的假病毒標準品,完美的克服了如上的缺點,非常適合用于核酸診斷性能評價的標準品。
科佰生物開發了基于NCBI公布序列的假病毒產品,用于各診斷試劑盒的性能評價,其對應的優點如下:
- hCov-OC43-N 假病毒標準品,區別于以往體外合成的RNA、臨床陽性活病毒,完美克服兩者的缺點,真正適合用于試劑盒的性能評價,包含檢測限、特異性,重復性等;
- 根據HCoV-OC43冠狀病毒的特點,選取了RdRp(RNA-dependent RNA polymerase)、Gene E(envelope protein)、Gene N(nucleocapsid phosphoprotein)合計3個區段的序列,用于假病毒的包裝,3個區段很好的表征了HCoV-OC43的特征序列;
- 科佰生物設計了ddPCR體系的引物、探針序列,可不需要構建標準曲線的前提下完成對假病毒的QC拷貝數檢測,非常準確表征標準品的拷貝數,而且克服了Q-PCR分析CT值的相對判斷標準的不準確性;
- hCov-OC43-N 假病毒標準品,無致病性,可再生,質控方法可靠,批次間穩定,可以長期穩定制備和供應,而且要求實驗室生物安全級別為P2,滿足很多單位的安全需求。